Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSFMP43897 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms