Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPD2P43304 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPD2P43304 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPD2P43304 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPD2P43304 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPD2P43304 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPD2P43304 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPD2P43304 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms