Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECI1P42126 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECI1P42126 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECI1P42126 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms