Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTGDSP41222 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms