Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms