Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms