Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms