Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms