Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT1P13805 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT1P13805 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNNT1P13805 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms