Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms