Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms