Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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