Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ3O43525 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms