Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DIRC3C9JPN6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DIRC3C9JPN6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms