Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms