Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NL46 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NL46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A6NL46 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A6NL46 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A6NL46 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A6NL46 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A6NL46 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms