Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBRG1-203ENST00000441174 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BNC2-202ENST00000380667 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A7-205ENST00000620288 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008060.4-201ENST00000569431 1861 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO2B-202ENST00000540068 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MERTK-202ENST00000409780 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms