Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPATA31E3P-201ENST00000613133 4214 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SLC8A1-203ENST00000403092 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 EEF1A1P13-201ENST00000503537 1389 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 PARP11-204ENST00000447133 4377 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MIR30C1-201ENST00000385227 89 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RN7SL403P-201ENST00000481783 305 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms