Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF2Q9Y5W3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms