Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms