Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms