Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms