Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN3Q9UKA8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms