Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms