Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms