Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms