Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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