Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms