Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms