Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA4Q9GZZ7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms