Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms