Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms