Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms