Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms