Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms