Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms