Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms