Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3EQ6PEY2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms