Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS3Q68E01 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms