Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms