Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIK1Q3SY52 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms