Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKPD1Q17RQ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms