Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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