Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SURF2Q15527 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SURF2Q15527 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms