Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms