Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD4Q14839 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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