Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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