Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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