Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
STX4Q12846 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STX4Q12846 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STX4Q12846 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STX4Q12846 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STX4Q12846 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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STX4Q12846 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STX4Q12846 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STX4Q12846 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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