Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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